Thèse soutenue le 11 décembre 2009 pour obtenir le grade de Docteur de l'Université de Rouen
Résumé:
Les plastes forment une famille d'organites, comprenant les chloroplastes, distribués de manière ubiquitaire dans les cellules végétales et qui, comme les mitochondries, dérivent d'un évènement endosymbiotique. Il était généralement admis que la majorité des protéines codées par le génome nucléaire et à destination des chloroplastes est synthétisée dans le cytosol sous forme de précurseurs présentant une séquence d'adressage N-terminale chloroplastique clivable, appelée « séquence de transit ». Cette « séquence de transit » permet aux précurseurs chloroplastiques d'être adressés puis importés vers les compartiments internes des chloroplastes
via le système de translocation TOC-TIC localisé au niveau des membranes externe et interne de l'enveloppe des chloroplastes [pour revue, Jarvis, 2008]. Cependant, la caractérisation en 2002 d'une nouvelle protéine de la membrane interne des chloroplastes dépourvue de séquence d'adressage chloroplastique N-terminale clivable [Miras
et al., 2002] et l'identification en 2005 d'une glycoprotéine transitant préalablement par le réticulum endoplasmique et l'appareil de Golgi avant d'être adressée puis importée vers les chloroplastes [Villarejo
et al., 2005] ont révélé l'existence d'autres voies d'adressage chloroplastique, dites « alternatives », indépendantes du système de translocation TOC-TIC. Dans ce contexte, mon travail de thèse avait pour but l'identification d'autres protéines empruntant des voies alternatives d'adressage chloroplastique en vue de déterminer les signaux contrôlant ces adressages particuliers. Pour ce faire, deux stratégies ont été retenues. La première était basée sur des méthodologies de capture spécifiques des N-glycoprotéines. La seconde stratégie était basée sur l'analyse protéomique systématique des différentes sous fractions chloroplastiques que sont l'enveloppe, le stroma et les thylacoïdes suivie de la recherche de protéines candidates par analyse
in silico. L'analyse de la localisation subcellulaire des protéines candidates ainsi sélectionnées révèlent une localisation chloroplastique pour trois protéines candidates dépourvues de séquence de transit d'adressage chloroplastique dont une potentiellement double localisée. Les signaux permettant à ces protéines candidates d'être importées au niveau des chloroplastes restent à déterminer.
Jury :
Rapporteur : Nadine Paris
Rapporteur : Yann Guerardel
Examinateur : Hélène Barbier-Brygoo
Examinateur : Xavier Pannecoucke
Examinateur : Jean-Claude Mollet
Examinateur : Patrice Lerourge
Examinateur : Norbert Rolland
Directeur de thèse : Patrice Lerourge
Directeur de thèse : Norbert Rolland
Mots-clés :
Arabidopsis thaliana, système endomembranaire, chloroplaste, séquence d'adressage N-terminale, glycosylation