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Chemogenomics and Chemical Genetics: A User's Introduction for Biologists, Chemists and Informaticians

​Ce livre est dédié à des biologistes, des chimistes et des débutants informaticiens. Il est organisé en chapitres courts, illustrés avec des exemples pratiques. Des définitions claires biologiques, chimiques et des concepts informatiques sont donnés dans un glossaire pour aider les lecteurs qui ne sont pas familiers avec l'une de ces disciplines. "Chemogenomics and Chemical Genetics» devrait donc être utile pour les étudiants (de niveau licence), les ingénieurs de plate-formes technologiques, et les chercheurs en biologie, chimie, bio-informatique, chimie informatique, à la fois dans les laboratoires de biotechnologie et universitaires.

Publié le 4 avril 2011


Édités par Éric Maréchal, Sylvaine Roy et Laurence Lafanechère
Springer-Verlag Berlin and Heidelberg
ISBN-10 : 3642196144
270 pages

Chemogenomics and Chemical Genetics: A User's Introduction for Biologists, Chemists and Informaticians

.........Plan.........

The pharmacological screening process: The small molecule, the biological target, the robot, the signal and the information.

Collections of molecules for screening: Example of the French National Chemical Library.

The miniaturised biological assay: Constraints and limitations.

The signal: statistical aspects, standardisation, elementary analysis.

Measuring bioactivity: Ki, IC50 and EC50.

Modelling the pharmacological screening: Controlling the processes and the chemical, biological and experimental information.

Quality procedures in automated screening.

Phenotypic screening of cells and the strategies for direct chemical genetics.

High information content screens for forward (phenotypic screening of organisms) and reverse (structural screening by NMR) chemical genetics.

Some principles of Diversity-Oriented Synthesis.

Molecular descriptors and similarity indices.

Lipophilicity of molecules: A predominant descriptor for QSAR.

The annotation and classification of chemical space in chemogenomics.

The annotation and classification of biological space in chemogenomics.

Machine learning and screening data.

Virtual screening by molecular docking.

Biodiversity as a source of small molecules for pharmacological screening: Libraries of plant extracts.